De Witt Clinton, maire de New York de 1803 à 1815, fut l'instigateur de plusieurs grands projets, dont celui d'un plan d'urbanisme de la ville.
L'île de Manhattan fut ainsi divisée selon une trame orthogonale : douze avenues dans le sens nord-sud et cent cinquante-cinq rues dans le sens est-ouest.
DeWitt Clinton (1769-1828), auquel on doit l'amélioration du système éducatif public de la ville, fut aussi à l'origine du percement du canal Erié, qui relie l'Hudson River aux Grands Lacs, et grâce auquel l'activité portuaire de New York se développa, pour rapidement dépasser celles de Boston et de Philadelphie.
En 1806, le premier bateau à vapeur, le Clermont, construit par l'ingénieur Robert Fulton, remonte en trente-deux heures le cours de l'Hudson vers la ville d'Albany. En 1825, le canal est totalement percé. Lors de l'inauguration, DeWit Clinton, alors gouverneur de l'Etat de New-York, en parcourt toute la longueur, de Buffalo à New York.
Les institutions évoluent également : le droit de vote, autrefois réservé à la classe possédante, s'élargit en 1820 à tous les citoyens blancs, s'affrachissant ainsi des distinctions d'argent mais nin de couleur.
La charte de 1857, séparant les élections municipales de celles de l'Etat de New York, entérine un différent de longue date opposant le parti démocrate de la ville et le parti républicain de l'Etat.
Pendant les années de guerre civile, de 1861 à 1865, New York apporte sa contribution : quelque 450 000 New-yorkais combattent pour l'Union.
Les usines tournent alors à plein régime. La ville entre dans l'âge d'or industriel. Les inégalités sociales se creusent. Le parti démocrate de Tammany Hall est solidement implanté à New York grâce à l'appui de la classe ouvrière et des immigrants. Il contrôle le pouvoir de 1865 à 1872, jusqu'à l'arrestation de son représentant, William Tweed, accusé de corruption et de détournement de fonds publics.
En 1896, le statut de la ville est consolidé par la réunion des comtés de Manhattan, Brooklyn, Queens, Bronx et Staten Island en une grande agglomération. En 1898, chacun de ces cinq comtés devient un des quartiers de la grande ville de New York dont la population atteint désormais trois millions et demi d'habitants.